公司法人代表是男方且股份只有男方一人时，婚后起诉离婚对公司的影响主要取决于公司的财产性质及双方协商或法院判决的结果。以下是详细分析：

1. 公司财产性质的判断：

   • 若公司是男方在婚前用个人财产出资设立的，那么公司通常属于男方的个人财产，离婚时归男方所有。
   • 若公司是婚后由夫妻共同财产出资设立的，那么公司一般属于夫妻共同财产。离婚时，双方可以协商处理，协商不成时，法院会根据具体情况作出判决，可能会判定公司归某一方所有，并给另一方相应的补偿。

2. 离婚对公司运营的影响：

   • 离婚本身并不直接导致公司运营的中断或终止。公司的存续和运营主要受到公司法、公司章程以及股东会、董事会等决策机构的影响。
   • 然而，离婚过程中可能涉及的股权分割、财产分配等问题，如果处理不当，可能会对公司的稳定性和运营产生一定影响。例如，股权的频繁变动可能会影响公司的决策效率和市场信誉。

3. 法律建议：

   • 在离婚过程中，如果涉及公司股权的分割，建议双方首先通过协商的方式解决。协商时可以考虑公司的经营状况、股东权益、债务等因素，以达成一个公平合理的分割方案。
   • 如果协商不成，可以寻求法院的帮助。法院会根据相关法律规定和实际情况，对股权进行公正合理的分割。
   • 无论结果如何，都应确保公司的决策程序和运营活动符合公司法和相关法律法规的要求，以维护公司的稳定性和市场信誉。

综上所述，公司法人代表是男方且股份只有男方一人时，婚后起诉离婚对公司的影响主要取决于公司的财产性质及双方协商或法院判决的结果。在处理过程中，建议双方保持理性、公正的态度，通过协商或法律途径妥善解决相关问题。