用人单位已注销，劳动者一般不能直接申请劳动仲裁。这是因为劳动仲裁需基于存在劳动关系的双方，而用人单位注销后，其主体资格消灭，无法作为劳动争议的一方当事人，也就无法明确被申请人。不过，劳动者仍有其他途径来维护自身权益，具体分以下情况讨论：
公司注销前有未结清债务：
- 若用人单位在注销前存在未结清的工资、经济补偿等劳动报酬纠纷，劳动者可以向用人单位的出资人、开办单位或主管部门，或是向清算组申报债权。清算组应当依据法律规定对劳动者的债权进行处理。
- 若清算组未依法处理劳动者债权，或者用人单位未经依法清算即办理注销登记，导致劳动者权益受损的，劳动者可以向法院提起诉讼，要求相关责任主体承担相应责任。此时，诉讼已不属于劳动仲裁的范畴，而是进入了民事诉讼程序。
股东存在未履行清算义务等情况：
- 倘若用人单位的股东存在未履行清算义务等情况，致使公司注销后劳动者权益受损，劳动者可依据具体状况，将股东、股份有限公司的董事和控股股东，以及公司的实际控制人列为被申请人提起相关诉讼，要求他们承担相应法律责任。
综上所述，虽然用人单位注销后劳动者不能直接申请劳动仲裁，但仍有多种法律途径可供劳动者选择以维护自身权益。劳动者在申请劳动仲裁或提起诉讼时，应准备好充分的证据材料，并遵循相关法律规定进行操作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。