农村三资合同清理是一个涉及农村集体经济合同管理的重要工作，旨在加强村级“三资”（资金、资产、资源）管理，深化农村集体产权制度改革，确保集体资产不流失、农民利益不受损，并促进农村集体经济发展壮大。以下是对农村三资合同清理的详细解答：

一、清理的范围

农村三资合同清理的范围主要包括村、组级农村集体经济组织（包括代行农村集体经济组织职责的村民或居民委员会、村民或居民小组）以及集体经济组织全资或控股的企业与自然人、法人以及非法人组织订立的正在履行和已签订尚未履行的各类合同。

二、清理的作用

农村三资合同清理的作用主要体现在以下几个方面：

1. 纠正和解决村级各类经济合同不合法、不规范、不合理等问题。
2. 切实维护村级集体经济组织及其成员的合法权益。
3. 确保集体资产不流失，农民利益不受损。
4. 促进农村集体经济发展壮大。

三、清理要达到的效果

通过农村三资合同清理，要摸排清楚农村集体经济合同，特别是那些历史形成时间长、存量大、问题多、情况复杂的合同，确保合同清理不留死角，承包费、租赁费应收尽收，合同台账应纳尽纳。

四、重点审查内容

在清理过程中，重点审查经济合同订立程序的合法性、承包（租赁、建设）方资质的有效性、经济合同条款的完整性、合同标的数量和质量的准确性、价款或者报酬的合理性、履行期限和方式以及违约责任、争议解决办法的明确性等。

五、合同签订的身份

村集体通常以股份经济合作社的名义对外签订合同。

六、问题合同的处理

对于低价发包、超法定期限、程序不合理、无偿占有、低价承包等问题合同，要确定合同纠正责任人，并优先通过协商、调解的方式进行调整纠正。协商、调解不成的，可通过仲裁、诉讼的方式依法进行处理。对于伪造合同、无合同强占村集体资产资源拒不归还也不缴纳承包费的，要移交公安、纪检监察部门处理。

同时，根据具体情况，对问题合同采取以下处理方式：

1. 实际面积或数量大于合同约定的，可收回大于标的物部分或补交承包费。
2. 合同内容显失公平、价格明显偏低的，可以重新约定价格，补交承包费。
3. 对已经到期承包方未履行义务继续经营的，按规定程序重新发包。
4. 对合同不兑现或拖欠承包款的，做好清收和兑现工作。
5. 无偿占用或使用村集体资源和其他生产经营项目的，依法收归集体，按规定程序公开发包。
6. 对不符合法律规定的超期限合同，协商进行调整；协商不成的，通过法律手段解决。

七、拖欠承包费的处理

对于拖欠承包费的合同，应按合同约定条款催缴收取承包费。规定期限拒不缴纳的，应发书面通知书解除合同，并通过诉讼程序追缴拖欠的承包费。

综上所述，农村三资合同清理是农村集体经济管理的一项重要工作，它对于维护农村集体经济组织和农民群众的权益、促进农村经济发展与社会和谐稳定具有重要意义。