针对您提出的问题“农商银行逾期低保钱会被自动扣款吗”，以下是我结合您提供的参考信息以及一般银行操作规范给出的详细解答：

首先，从您提供的参考信息来看，确实存在过银行因系统设置自动扣收，导致低保户的低保救助金被用于偿还逾期贷款的情况。这主要发生在某些地区的农商银行，它们在与建档立卡贫困户签订《个人信用借款合同》时，约定了“借款人应于每期还款日前在账户中存入款项，贷款人可直接从该账户中划收借款本息”的条款。然而，这种操作在实践中可能引发了问题，如低保户因未能及时还款而导致低保金被扣划，进而影响了他们的基本生活。

针对这一问题，江苏省政府已经采取了相应措施进行纠正。在您的参考信息中提到的案例中，灌南县农村商业银行已经对逾期扶贫贷款取消了自动扣款功能，并进行单独监测，以防止类似情况再次发生。这表明，至少在某些地区，银行已经意识到这一问题并采取了积极措施进行改进。

然而，需要注意的是，不同地区的农商银行可能有着不同的操作规范和政策。因此，不能一概而论地说所有农商银行都会或都不会在逾期情况下自动扣款低保金。为了获得最准确的信息，建议您直接咨询您所在地的农商银行或相关政府部门，了解当地的政策和操作规范。

总的来说，虽然过去在某些地区存在过低保金被自动扣款用于偿还逾期贷款的情况，但政府和相关金融机构已经在积极采取措施进行纠正和改进。为了确保您的权益不受侵害，建议您及时了解并关注当地的政策和操作规范，并在必要时寻求专业咨询或帮助。