公司骗贷即使后续进行偿还，也仍需承担法律责任，但退赃行为在刑事和后续可能的民事程序中可能产生积极影响。具体处理方式需根据案件情况和相关法律规定综合判断，以下是对此问题的详细分析：
一. 刑事责任处理
继续追究刑事责任：
- 诈骗罪是刑事公诉案件，公司若实施骗贷行为，即损害了金融秩序和法律权威性。因此，即使公司退还了贷款，公安机关仍会按照法定程序继续对案件进行侦查。
- 检察院在审查案件时，也会综合考虑公司的退赃情况、犯罪情节等多方面因素，若认为犯罪情节严重或不符合不起诉条件，将提起公诉。
从轻或减轻处罚：
- 若公司骗贷情节较轻且积极退赃、认罪悔罪表现良好，在公安机关阶段，公安机关可向检察院提出从轻处理的建议。
- 检察院在量刑建议中，通常会将积极退赃作为从轻处罚的情节予以考虑。
- 法院在审理案件时，对于积极退赃的公司，也通常会从轻处罚。
特定情况下的不追究或减轻刑事责任：
- 在特定情况下，如公司骗贷金额刚达到立案标准，且系初犯，在案发后第一时间主动退还全部赃款并真诚悔罪，取得了被害人谅解，检察院有可能根据具体情况作出不起诉决定。
二. 民事赔偿责任
- 若公司的骗贷行为给金融机构造成了其他经济损失，金融机构可在刑事诉讼结束后单独提起民事诉讼，要求公司赔偿合理的经济损失。
三. 追回钱款的处理
- 根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，若公司骗贷所得的钱被追回，应当及时返还给金融机构。
四. 后续经营与预防措施
- 公司应深刻反省骗贷行为，加强内部合规管理，完善风险防控机制，避免再次涉及违法犯罪行为。
我建议，公司应积极配合司法机关的调查，同时寻求专业法律咨询，以了解具体的法律责任和可能的法律后果。如有进一步需要，您可以继续咨询我。