知识产权行政执法与司法保护之间的关系是相辅相成、互为补充的。两者在知识产权保护体系中各自扮演着重要的角色，并共同致力于维护知识产权的合法权益和市场的公平竞争。

首先，知识产权行政执法是知识产权保护体系中的重要一环。它主要通过行政手段，如检查、监督、处罚等，来打击侵犯知识产权的行为，维护市场秩序。行政执法具有快速、灵活的特点，能够迅速响应市场中的侵权行为，及时制止和纠正不法行为。

其次，司法保护是知识产权保护的另一重要手段。它主要通过司法程序，如诉讼、仲裁等，来解决知识产权纠纷，维护权利人的合法权益。司法保护具有权威性、公正性和终局性的特点，能够为权利人提供有力的法律保障。

在协调知识产权行政执法与司法保护的关系时，可以从以下几个方面入手：

一、加强信息共享与沟通。行政执法部门和司法部门应建立有效的信息共享机制，及时交流知识产权案件的相关信息，以便更好地掌握市场动态和侵权情况，提高执法和司法的准确性和效率。同时，双方还应加强沟通协作，共同研究解决知识产权保护中的难点问题。

二、完善衔接机制。行政执法和司法保护在程序上应相互衔接，确保案件处理的连贯性和一致性。例如，可以建立案件移送制度，对于行政执法中发现的涉嫌犯罪案件，应及时移送司法机关处理；对于司法机关需要行政执法部门协助的案件，行政执法部门应积极配合。

三、强化协同保护。行政执法和司法保护应相互支持、相互配合，形成保护合力。例如，可以联合开展专项执法行动，共同打击侵犯知识产权的行为；可以共同建立知识产权纠纷调解机制，促进纠纷的快速解决；可以加强宣传和教育，提高公众对知识产权的认识和尊重。

综上所述，知识产权行政执法与司法保护在知识产权保护体系中各自发挥着重要作用。通过加强信息共享与沟通、完善衔接机制、强化协同保护等措施，可以更有效地协调两者之间的关系，共同构建知识产权“严保护、大保护、快保护、同保护”的工作格局。