在女方起诉离婚而男方第二次仍然不同意的情况下，法院是否会判决离婚，关键在于夫妻双方的感情是否确实已经破裂。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法院判断标准：

   • 法院在审理离婚案件时，会综合考虑多方面因素，包括婚姻基础、婚后感情、离婚原因、夫妻关系现状及有无和好可能等。
   • 若经审理认定感情确已破裂，即便一方不同意，法院也可判决离婚。比如存在重婚或与他人同居、实施家庭暴力或虐待遗弃家庭成员、有赌博吸毒等恶习屡教不改、因感情不和分居满二年等法定情形。

2. 女方应做的准备：

   • 积极收集并准备能证明夫妻感情破裂的证据，如分居证明、家暴证据、对方重婚或与他人同居的证据等。
   • 清晰阐述自己的诉求和理由，积极配合法院的审理工作。

3. 法律程序：

   • 女方有权继续向法院提出离婚申请，不受男方是否同意的影响。
   • 若第一次起诉离婚未被法院批准，女方可以在判决生效后六个月再次起诉，此时判决离婚的可能性会增加。

4. 可能的结果：

   • 若法院认定夫妻感情确已破裂，且女方提供了充分的证据，法院很可能会判决离婚。
   • 若法院认为夫妻感情尚未破裂，或女方提供的证据不足，法院可能会判决不准离婚。

5. 后续事项：

   • 若法院判决离婚，接下来还需要处理财产分割、子女抚养权等问题。
   • 若法院判决不准离婚，女方可以根据法律规定，在符合条件后再次提起离婚诉讼。

综上所述，女方起诉离婚而男方第二次仍然不同意时，法院会根据夫妻感情是否确实破裂以及女方提供的证据来综合判断。女方应积极准备证据，清晰阐述诉求，并配合法院的审理工作。若你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。