“犯罪事实已经查清”与“犯罪事实清楚”在刑事法律程序中具有不同的含义，主要体现在查证的深度和范围上。
“犯罪事实已经查清”：
- 这是检察机关提起公诉的重要前提，意味着对所有与定罪量刑相关的事实都进行了全面、深入且细致的查证。
- 它要求检察机关对定罪量刑的事实都有充分证据证明，证据的合法性与真实性得到确认，证据链完整且一致，犯罪主体、犯罪行为与结果、犯罪主观方面以及犯罪情节等相关事实均已查明。
- 在某些特定情形下，如单一罪行案件中足以定罪量刑的事实已经查清，或数个罪行案件中部分罪行已查清并符合起诉条件等，也可以确认犯罪事实已经查清。
“犯罪事实清楚”：
- 这通常是一个相对较为宽泛的表述，指的是犯罪的基本事实已经明确，没有重大的疑问或模糊之处。
- 它可能不涉及对所有细节的全面查证，而是侧重于犯罪的主要事实和基本情节是否清晰。
- “犯罪事实清楚”可能不足以直接支持检察机关提起公诉，还需要进一步的查证和补充证据，以达到“犯罪事实已经查清”的标准。
综上所述，“犯罪事实已经查清”是一个更为严格和全面的标准，它要求检察机关对案件的所有相关事实进行深入的查证和确认，以确保案件处理的公正性和准确性。而“犯罪事实清楚”则是一个相对较为宽泛的表述，侧重于犯罪的基本事实和情节的明确性。在刑事法律程序中，检察机关通常需要确保犯罪事实已经查清，才能依法提起公诉。