做亲子鉴定对6岁孩子身体没有实质性影响。亲子鉴定主要是通过采集孩子的DNA样本与父母的DNA样本进行比对，以确认亲子关系。这个过程通常是非常安全的，不会对孩子的身体健康造成任何损害。

在具体操作上，采集DNA样本的方式通常包括采集口腔拭子、血液或头发等，这些采集方式都是非侵入性的，不会对孩子造成疼痛或不适。而且，整个采集过程非常快速，孩子只需要配合几分钟就可以完成。

当然，虽然亲子鉴定本身对孩子身体没有影响，但在进行亲子鉴定时，还是需要注意保护孩子的隐私和心理健康。家长应该与孩子进行充分的沟通，解释清楚进行亲子鉴定的原因和目的，以避免孩子产生不必要的疑虑或恐惧。

总之，从医学和法律的角度来看，做亲子鉴定对6岁孩子的身体是没有实质性影响的。如果您有任何关于亲子鉴定的具体问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会为您提供更详细和专业的解答。