检察院不起诉一般情况下不会留下案底，对子女通常没有影响。但具体是否留有案底及对子女的影响需根据不起诉的具体原因和法律依据来判断。
案底的概念及不起诉与案底的关系
案底一般指某人过去违法或犯罪行为的记录，又称犯罪人员犯罪记录制度。在我国，只有经过法院依法审判，判处有罪的人才会有案底。检察院作出不起诉决定，意味着案件在检察环节就终止了，没有进入法院审判阶段。未经法院依法判决有罪，从法律层面上来说，就不构成犯罪，因此不会留下案底。
不起诉的情形及其对子女的影响
法定不起诉（绝对不起诉）
- 适用情形：根据《刑事诉讼法》第十六条，情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的等情形，人民检察院应当作出不起诉决定。
- 对子女影响：由于当事人不被认定为犯罪，不会有案底，因此对子女的参军、报考公务员、就业等方面一般不会产生影响。
酌定不起诉（相对不起诉）
- 适用情形：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
- 对子女影响：虽然当事人的行为构成犯罪，但由于情节轻微等原因不需要判处刑罚，检察院作出不起诉决定后，同样不会留下案底，通常也不会对子女产生不利影响。
存疑不起诉（证据不足不起诉）
- 适用情形：对于补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉的决定。
- 对子女影响：存疑不起诉是因为证据问题无法认定犯罪，并非确定有罪，所以也不会有案底，一般对子女没有影响。
特殊情况及现实考量
- 特殊行业或岗位：在一些涉及国家安全、机密等特殊领域的招聘中，可能会对候选人的背景进行更为严格的审查。即使检察院不起诉且没有案底，相关记录也可能在一定程度上影响子女的入职。
- 具体单位或机构的政策：某些单位或机构可能会制定更为严格的内部规定，对于有亲属曾涉及刑事诉讼程序的情况进行限制。在这种情况下，检察院不起诉的记录可能会对子女的就业产生一定影响。
综上所述，检察院不起诉是否留有案底及其对子女的影响取决于不起诉的具体原因和法律依据。在大多数情况下，如果没有违法犯罪事实而被决定不起诉，则不会对子女产生不良影响。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的解答，请直接向我咨询。