失信被执行人三年后死亡，其债务仍需清偿，一般由其遗产进行偿还。具体分析如下：

一. 债务清偿责任

1. 继承遗产需继承债务：根据《中华人民共和国民法典》第一千一百六十一条规定：“继承人以所得遗产实际价值为限清偿被继承人依法应当缴纳的税款和债务。超过遗产实际价值部分，继承人自愿偿还的不在此限。继承人放弃继承的，对被继承人依法应当缴纳的税款和债务可以不负清偿责任。”这意味着，如果失信被执行人死亡，其继承人需要在继承遗产的范围内清偿其债务。
2. 遗产管理人或遗嘱执行人的责任：在有些情况下，如果没有继承人或者继承人放弃继承，那么遗产管理人或遗嘱执行人可能需要负责处理债务问题，依据法律规定进行清偿。

二. 债务清偿程序

1. 确定遗产范围：首先，需要明确失信被执行人的遗产范围，包括房产、存款、股票等所有可执行的财产。
2. 债务清偿：在遗产确定后，按照法律规定的顺序进行债务清偿，包括但不限于税款、债权人的债务等。
3. 遗产分配：在清偿完债务后，剩余的遗产才能按照法定继承或遗嘱继承的方式进行分配。

三. 特殊情况处理

1. 遗产不足以清偿债务：如果失信被执行人的遗产不足以清偿全部债务，那么债权人可能只能按照比例获得部分清偿。
2. 无遗产或遗产无法执行：在某些情况下，如果失信被执行人没有遗产或者遗产无法执行（如财产已转移、隐匿等），那么债权人可能面临无法追偿的风险。

我建议在处理此类问题时，应首先明确失信被执行人的遗产范围，并依法进行债务清偿。如果涉及复杂的法律问题或争议，建议寻求专业法律帮助以确保权益得到妥善保护。如有进一步需要，您可以继续咨询我。