关于“有限责任公司增加注册资本，小股东不同意”的问题，首先我们要明确的是，公司增资是一个需要股东会决议的重大事项。以下是我对此问题的详细解答：
结论前置
在有限责任公司中，增加注册资本需要代表三分之二以上表决权的股东同意。如果小股东不同意增资，但大股东持有的表决权超过三分之二，那么增资决议依然可以通过。对于不同意增资的小股东，其股份可能会被稀释，或者由同意增资的股东以公平价格收购其股份。
详细解答
增资决议的通过条件：
- 根据《公司法》的相关规定，公司增资应当由股东会决定，且必须经代表三分之二以上表决权的股东通过。这意味着，只要大股东持有的表决权超过三分之二，即使小股东不同意，增资决议也可以被通过。
小股东不同意增资的处理：
- 股份稀释：如果小股东不同意增资，但增资决议依然通过，那么小股东在公司中的股份比例将会因为新资本的注入而被稀释。这是因为新资本的注入会改变公司总的股本结构，而不同意增资的小股东所持有的股份数量并未增加，因此其比例会相应下降。
- 股份收购：另一种处理方式是，同意增资的股东可以以公平价格（如公司净资产）收购不愿意增资的小股东的股份。这样，小股东可以退出公司，而同意增资的股东则能够继续推动公司的发展。
特殊情况下的处理：
- 如果公司章程中对增资有特别规定，如需要更高比例的股东同意，那么应当遵循公司章程的规定。
- 如果小股东对增资决议有异议，并且认为该决议违反了法律或公司章程的规定，那么他们可以通过法律途径来维护自己的权益，比如提起股东诉讼。
建议与提醒：
- 在进行增资操作前，建议公司充分与小股东沟通，尽量达成一致意见，以避免后续的纠纷和矛盾。
- 如果小股东确实不同意增资，并且双方无法达成一致，那么公司应当考虑采取合法、合理的方式来处理这一分歧，以确保公司的稳定和发展。
综上所述，有限责任公司增加注册资本时，如果小股东不同意，但大股东持有的表决权超过三分之二，那么增资决议依然可以通过。对于不同意增资的小股东，其股份可能会被稀释或由同意增资的股东收购。在处理这一过程中，公司应当遵循法律和公司章程的规定，并尽量通过沟通来达成一致意见。