针对未办理超限运输证的车辆，根据《公路安全保护条例》、《中华人民共和国道路交通安全法》以及其他相关法规，将可能面临一系列严格的法律处罚措施及法律责任。以下是对此问题的详细解答：
一、明确结论
未办理超限运输车辆通行证擅自进行运输，是违法行为，将受到法律的制裁，包括但不限于责令停止违法行为、罚款、扣留车辆，甚至可能追究刑事责任。
二、具体处罚措施
责令停止违法行为与经营：
- 公路管理机构或县级以上道路运输管理机构有权要求当事人立即停止超限运输的违法行为，以保障公路设施的安全和道路运输的合法性。
罚款：
- 罚款金额根据超限程度的不同而有所差异：
- 对于车货总高度、宽度、长度未超过一定标准的轻微超限行为，可处以200元以下的罚款；
- 若超限情况较为严重但尚未达到特别严重程度，将处以200元以上1000元以下的罚款；
- 对于严重的超限行为，罚款金额将提高至1000元以上3000元以下；
- 若车货总质量超标，还将根据超重量进行额外罚款，最高罚款金额不超过30000元。
- 此外，若存在违法所得，相关部门将没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款；若无违法所得或违法所得不足2万元，将处以3万元以上10万元以下的罚款。
扣留车辆：
- 公安机关交通管理部门有权依法扣留未办理超限运输许可证或未消除超限状态的涉案车辆，直至车主或驾驶员提供有效的超限运输许可证或消除超限状态。
其他行政处罚：
- 根据具体情况，还可能面临警告、吊销驾驶证等其他行政处罚措施。
追究刑事责任：
- 如果未办理超限运输车辆通行证的行为构成犯罪，如造成严重后果或屡教不改，将依法追究刑事责任，可能面临刑事拘留、有期徒刑等更严重的法律后果。
三、重要法律知识点与预防建议
超限运输车辆通行证的重要性：
- 超限运输车辆通行证是一车一证，仅限于本超限运输车辆在规定的时间、路线和速度进行道路运输使用。未经许可，不得擅自行驶公路。
地区实施细则：
- 不同地区可能根据本地实际情况，在法律规定的幅度范围内制定具体的实施细则和裁量标准。因此，车主或驾驶员应了解并遵守当地的具体规定。
预防与建议：
- 为避免处罚，车主或驾驶员应严格遵守相关法律法规，确保在进行超限运输前依法办理相关手续，并按照规定的时间和路线行驶。
- 同时，也应定期检查车辆状态，确保车辆符合道路交通安全标准，以避免因车辆问题而引发的超限运输违法行为。
综上所述，未办理超限运输车辆通行证将面临严厉的法律处罚。因此，建议车主或驾驶员在从事超限运输前务必了解并遵守相关法律法规，确保合法合规地进行道路运输。