首先，我们需要明确一点：子公司帮母公司多次支付工程款，这一行为涉及公司间的财务往来和可能的法律关系调整。针对这一情况，以下是我作为律师给出的专业建议：

1. 明确支付性质与目的：

   • 首先，要清晰界定这些支付是借款、垫付款、还是其他性质的支付。
   • 明确支付的目的，是为了解决母公司的临时资金短缺，还是作为投资、赠与等。

2. 完善财务记录与协议：

   • 子公司和母公司之间应签订正式的书面协议，明确支付金额、支付方式、还款期限（如适用）、利息（如适用）等关键条款。
   • 在财务记录中准确反映这些支付，确保账目的清晰和透明。

3. 遵守公司法与税法规定：

   • 检查公司章程，确保支付行为不违反公司法的规定，特别是关于资金运作、关联交易等方面的规定。
   • 咨询税务专家，确保支付行为符合税法要求，避免潜在的税务风险。

4. 考虑法律后果与风险：

   • 如果支付被视为借款，那么应关注借款的合法性、利息的约定以及还款的保障。
   • 如果支付被视为投资或赠与，那么应关注相应的法律后果，如股权变动、资本公积的增加等。

5. 加强内部治理与监管：

   • 子公司和母公司应建立健全的内部治理机制，确保支付行为的决策过程合法、合规。
   • 加强对支付行为的监管，防止滥用职权、利益输送等违法违规行为的发生。

综上所述，子公司帮母公司多次支付工程款是一个需要谨慎处理的问题。建议子公司和母公司之间加强沟通、明确支付性质与目的、完善财务记录与协议、遵守公司法与税法规定，并加强内部治理与监管，以确保支付行为的合法、合规和有效。如果您在具体操作中遇到任何法律问题，欢迎随时向我咨询。