如果回迁房购房协议丢失了，您可以按照以下步骤进行补办：

首先，您需要前往房管局的住房保障部门。在到达后，向工作人员说明合同丢失的情况，并提供相关的身份证明和房屋信息。这些身份证明可能包括您的身份证、户口本等，而房屋信息可能包括房产证、房屋地址等。工作人员会根据您提供的信息，在系统中查询备案记录。

确认您的身份和房屋信息无误后，房管局会根据备案信息为您重新出具一份回迁房合同，并加盖公章以确认其法律效力。请注意，整个补办过程可能需要一定的时间，所以请您耐心等待。

另外，如果您急需一份回迁协议书的复印件，而原件又已丢失，您可以尝试联系拆迁人。因为回迁协议书一般都有两份，拆迁人那里会保存一份存档。您可以携带个人身份证明和房屋相关信息，前往拆迁人处说明情况，并请求复印一份协议书。在复印时，请确保协议书内容完整、清晰，并请拆迁人加盖其公章，这样您就可以得到一份具有法律效力的回迁协议书复印件。

总的来说，虽然回迁房购房协议的丢失可能会给您带来一些不便，但只要按照上述步骤进行补办，您的权益是不会受到影响的。希望这个解答能够帮助到您。