当精神病二级残疾证人违法时，处理流程主要遵循法律法规和残疾人证管理的相关规定。以下是对此问题的详细解答：

一、明确法律责任

首先，需要明确的是，精神病二级残疾证人虽然持有残疾人证，但并不意味着他们在法律上可以免责。残疾人同样需要遵守国家的法律法规，如果违法，将依法承担相应的法律责任。

二、处理流程

1. 违法行为发现与报告：

   • 当发现精神病二级残疾证人存在违法行为时，相关机构或个人应及时向公安机关或其他有关部门报告。

2. 公安机关调查处理：

   • 公安机关接到报告后，将依法对违法行为进行调查。这包括收集证据、询问当事人、了解事情经过等。
   • 如果违法行为构成犯罪，公安机关将依法立案侦查，并按照刑事诉讼程序进行处理。

3. 残疾人证管理机构的配合：

   • 在处理过程中，残疾人证管理机构（如残联）可能需要配合公安机关的调查，提供残疾人的相关信息和资料。
   • 如果残疾人的违法行为与其残疾状况有关，或者残疾人证存在虚假、过期等情况，残联将依据相关规定对残疾人证进行核查和处理。

4. 法律责任的承担：

   • 根据违法行为的性质和情节，残疾人可能需要承担行政责任（如罚款、拘留等）或刑事责任（如有期徒刑、拘役等）。
   • 同时，如果残疾人的违法行为导致了他人损害，还需要承担民事责任，即赔偿受害人的损失。

5. 残疾人证的后续处理：

   • 如果残疾人的违法行为严重违反了残疾人证的使用规定，或者残疾人证存在虚假、过期等情况，残联有权对残疾人证进行注销或调整等级。
   • 残联将定期对残疾人证进行审验核查，确保残疾人证的真实性和有效性。

三、特殊考虑

在处理精神病二级残疾证人的违法行为时，还需要考虑到其精神状况对行为能力的影响。如果残疾人因精神状况而无法完全理解或控制自己的行为，可能需要依法进行精神病学鉴定，以确定其刑事责任能力或民事行为能力。

四、总结

综上所述，当精神病二级残疾证人违法时，将依法进行处理。处理流程包括违法行为的发现与报告、公安机关的调查处理、残疾人证管理机构的配合、法律责任的承担以及残疾人证的后续处理。在处理过程中，需要充分考虑到残疾人的特殊情况和精神状况对行为能力的影响。