核心结论：当配套商品房供应单与安置动迁协议不一致时，首先需要确定两者之间的具体差异，并依据相关法律法规及合同条款，判断哪一份文件具有更优先的法律效力。一般来说，安置动迁协议作为拆迁双方协商一致的结果，具有较高的法律效力。但若供应单中有明确的法律规定或政府政策作为依据，且这些规定或政策与安置动迁协议相冲突，则可能需要进一步分析确定。

详细分析：

1. 核对差异：

   • 首先，应详细核对配套商品房供应单与安置动迁协议中的具体内容，找出两者之间的不一致之处。
   • 差异可能涉及房屋面积、位置、价格、交付时间、补偿方式等多个方面。

2. 分析法律效力：

   • 安置动迁协议通常是拆迁人与被拆迁人之间经过协商达成的一致意见，具有合同性质，对双方均具有法律约束力。
   • 配套商品房供应单可能是由开发商或相关部门出具的，用于明确房屋供应的具体细节。其法律效力可能因具体内容和出具主体的不同而有所差异。
   • 若供应单中的内容与安置动迁协议相冲突，且供应单是基于政府政策或法律法规出具的，那么需要仔细分析这些政策或法规是否对安置动迁协议产生了影响或限制。

3. 处理建议：

   • 若不一致之处对您的权益产生了重大影响，建议及时与拆迁方或开发商进行沟通协商，寻求解决方案。
   • 若协商无果，可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。例如，咨询专业律师（即我），了解具体的法律救济途径，如诉讼或仲裁等。
   • 在处理过程中，应保留好所有相关的证据材料，如供应单、安置动迁协议、沟通记录等，以便在需要时提供证明。

4. 法律后果：

   • 若未能妥善处理不一致之处，可能会导致您的权益受到损害，如无法按时获得预期的房屋、无法获得足够的补偿等。
   • 通过法律途径维护权益时，若能够证明对方存在违约或违法行为，可能会获得相应的法律赔偿或救济。

综上所述，当配套商品房供应单与安置动迁协议不一致时，应首先核对差异并分析法律效力，然后根据具体情况采取相应的处理措施。如有需要，请及时向我咨询以获取更专业的法律建议。