被收购方控股股东被交易所出具警示函，一般情况下不会影响重组，但具体需结合实际情况判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 法规依据：

   • 根据《上市公司信息披露管理办法》及相关规定，上市公司或其控股股东、实际控制人因信息披露违规等行为被出具警示函，并不直接构成重大资产重组的障碍。
   • 《上市公司重大资产重组管理办法》中明确规定了重组的条件，其中并未将上市公司或其控股股东被出具警示函列为禁止重组的情形。

2. 实际影响分析：

   • 短期影响：被出具警示函可能会引起投资者的关注，甚至可能引发股价的短期波动。这是因为投资者可能会担心公司的治理或信息披露存在问题，从而选择抛售股票。但这种影响通常是短期的，且随着公司后续的信息披露和整改措施，股价会逐渐恢复。
   • 长期影响：如果公司能够迅速整改，加强内部治理和信息披露的规范性，那么被出具警示函的长期影响将相对有限。相反，如果公司未能及时整改，或者存在持续的信息披露违规等行为，那么这可能会对公司的声誉和长期发展产生不利影响，进而可能影响到重组的进程和结果。

3. 特殊情况考虑：

   • 如果被收购方控股股东被出具警示函的原因涉及严重的违法违规行为，如欺诈、内幕交易等，那么这可能会引发监管机构的进一步调查或审查，从而对重组产生更大的不确定性。
   • 此外，如果重组方对被收购方的治理和信息披露情况有严格要求，那么被出具警示函可能会成为重组方评估被收购方价值的一个重要因素。

综上所述，被收购方控股股东被交易所出具警示函一般情况下不会影响重组，但具体还需结合实际情况进行判断。如果公司能够迅速整改并加强内部治理和信息披露的规范性，那么这种影响将是有限的。如果涉及更严重的违法违规行为或重组方有严格要求，那么可能会对重组产生更大的影响。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。