合同只盖公章别人代签字，其有效性需根据具体情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一般情况下合同有效
根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。公章作为公司对外意思表示的重要凭证，具有代表公司的法定效力。因此，在一般情况下，即使合同上是由别人代签字，但只要加盖了公司的公章，通常视为公司对合同内容的认可和承诺，合同依法成立并有效。
特殊情况下可能影响合同效力
约定生效条件：
- 如果合同中明确约定了特定的生效条件，如“合同必须经法定代表人签字并加盖公章后才生效”，那么仅加盖公章而未经法定代表人签字，合同可能因未满足约定的生效条件而不生效。
法律、行政法规的特殊规定：
- 对于某些特定类型的合同，法律、行政法规可能规定了额外的生效要求，如需要经过特定程序或审批。在这种情况下，仅盖公章可能不符合法定要求，会影响合同的效力。
代签字的法律效力：
- 如果代签字的人没有获得公司或法定代表人的明确授权，其代签字行为可能构成无权代理，导致合同效力待定。若公司或法定代表人后续对代签字行为予以追认，则合同有效；若不予追认，则合同无效。
注意事项与建议
确保合同内容合法：
- 无论合同是否加盖公章或代签字，合同的内容必须符合法律规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。
明确约定生效条件：
- 在签订合同时，建议双方明确约定合同的生效条件，包括是否需要法定代表人签字、是否需要办理特定手续等，以确保合同的合法性和有效性。
加强公章管理：
- 公司应加强对公章的管理，确保公章的使用符合公司规定和法律法规的要求，防止公章被滥用或盗用。
及时咨询专业法律人士：
- 若因合同效力问题产生纠纷或疑问，建议及时向我咨询，以获取准确的法律意见和解决方案，维护自身合法权益。
综上所述，合同只盖公章别人代签字时，其有效性需根据合同的具体约定、相关法律法规以及代签字人的授权情况等综合判断。为确保合同的合法性和有效性，建议在签订合同时明确约定生效条件，并加强公章管理。如有任何疑问或纠纷，请随时向我咨询。