企业与行政单位签订的还款协议在多数情况下是有效的，但其有效性取决于是否满足一定的法律条件。以下是对这一问题的详细分析：

1. 有效条件：

   • 行为人具备民事行为能力：企业与行政单位作为独立的民事主体，在签订还款协议时，应确保双方均具备相应的民事行为能力，即有能力为自己的行为负责。
   • 意思表示真实：还款协议应体现双方的真实意愿，不存在欺诈、胁迫等不当情形。这意味着双方在签订协议时，应对还款事宜有清晰、准确的认知和共识。
   • 内容合法合规：协议内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得损害国家、集体或第三人的利益，也不得违背公序良俗。例如，协议中应明确还款的金额、时间、方式等具体条款，且这些条款应符合法律规定。

2. 无效情形：

   • 若还款协议存在以合法形式掩盖非法目的、恶意串通损害第三人利益、违反法律强制性规定等情形，则该协议可能被视为无效。
   • 如一方以欺诈、胁迫的手段订立协议，损害国家利益，或协议内容严重违背公序良俗，也会被认定无效。

3. 法律后果：

   • 一旦还款协议被认定为有效，双方均应按照协议约定履行义务。如一方违约不还款，另一方有权依据协议通过诉讼等法律途径要求对方履行还款义务，并承担违约责任。
   • 若协议被认定为无效，则自始不具有法律约束力。双方应根据各自过错承担相应责任，如返还财产、赔偿损失等。

综上所述，企业与行政单位签订的还款协议在多数情况下是有效的，但具体有效性需根据协议内容、双方行为及法律规定进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。