您好，关于“员工手册超过多少比例有效”这个问题，其实并不是一个简单的比例问题，而是需要根据员工手册的具体内容、公司的相关规定以及法律法规来综合判断。
首先，员工手册作为公司内部的管理文件，其有效性并不取决于某个固定的比例，而是要看其内容是否合法、合理，是否经过了合法的制定和公示程序，以及员工是否已知晓并同意其中的内容。
内容合法性：员工手册中的内容必须符合国家法律法规的规定，不能违反法律强制性规定，否则该部分内容将无效。
制定和公示程序：员工手册的制定应当经过民主程序，如征求员工意见、与员工代表协商等，并确保员工有途径知晓手册的内容。如果制定和公示程序存在瑕疵，可能会影响员工手册的有效性。
员工知晓与同意：员工应当有机会阅读并理解员工手册的内容，并明确表示同意遵守其中的规定。如果员工对手册内容不知情或未同意，那么手册中的某些条款可能对员工不具有约束力。
因此，无法简单地给出一个“超过多少比例有效”的答案。如果您对员工手册的具体条款有疑问，或者认为公司在执行员工手册时存在不当行为，建议您详细查阅员工手册的相关内容，结合公司的实际情况和法律法规进行判断。如有需要，您可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。