五年基准刑减40%后，剩余刑期为3年。具体计算过程如下：

1. 确定基准刑：5年（假设为满额刑期，无缓刑或附加条件）。
2. 计算40%的时长： [ 5 \text{年} \times 40\% = 2 \text{年} ]
3. 减去相应时长： [ 5 \text{年} - 2 \text{年} = 3 \text{年} ]

在实际的司法量刑体系中，基准刑的减少有着严谨的法律依据和考量。减刑需符合法定条件，如罪犯在服刑期间有立功表现、确有悔改表现等情况，且减刑程序必须严格按照刑事诉讼法和监狱法等相关法律法规规定的程序来进行。并非仅仅依据数学计算就能实现减刑。

如果你对此类法律问题有更多疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会尽我所能为你提供帮助。