针对“处方诊断与开具药品不符，卫生监督机构如何处罚”的问题，首先我们要明确，这种情况通常涉及到医疗机构的诊疗行为和药品管理规定的违规。具体处罚会依据违规的严重程度、相关法律法规以及地方政策来综合判定。

一、违规性质分析

处方诊断与开具药品不符，可能属于以下几种情况之一：

1. 错误诊断：医生在诊断时出现失误，导致开具的药品与诊断不符。
2. 故意违规：医生或医疗机构为了某种目的（如经济利益），故意开具与诊断不符的药品。
3. 管理不善：医疗机构在药品管理、处方审核等方面存在漏洞，导致此类错误发生。

二、可能的处罚措施

根据《中华人民共和国药品管理法》、《处方管理办法》等相关法律法规，卫生监督机构对处方诊断与开具药品不符的医疗机构或个人，可能采取以下一种或多种处罚措施：

1. 警告：对于首次发现或情节较轻的违规行为，卫生监督机构可能会给予警告，并要求立即改正。

2. 罚款：根据违规的严重程度和造成的后果，卫生监督机构可能会对医疗机构或个人处以一定数额的罚款。

3. 暂停执业活动：对于情节较重的违规行为，如故意违规或多次违规，卫生监督机构可能会暂停医生或医疗机构的执业活动，直至整改完毕。

4. 吊销执业证书：对于情节特别严重或造成严重后果的违规行为，卫生监督机构可能会吊销医生或医疗机构的执业证书。

5. 其他行政处罚：如没收违法所得、没收违规药品等。

三、实际案例参考

以您提供的案例为例，A医院通过虚假处方销售药品，被认定为未取得药品经营许可证从事药品经营的行为，最终可能面临责令关闭、没收违法销售的药品和违法所得，并处以高额罚款的处罚。

四、建议与预防措施

为了避免处方诊断与开具药品不符的情况发生，医疗机构和个人应该：

1. 加强培训：提高医生的诊疗水平和药品知识，确保诊断准确、用药合理。
2. 完善管理：建立健全药品管理制度和处方审核机制，确保药品的购进、使用、销售等环节符合规定。
3. 加强监督：卫生监督机构应加强对医疗机构的监督检查，及时发现和纠正违规行为。

综上所述，处方诊断与开具药品不符是一种严重的违规行为，卫生监督机构将依据相关法律法规进行严厉处罚。医疗机构和个人应该加强自律和管理，确保诊疗行为和药品管理的合规性。