当遇到法院判决遗产继承份额后5年房产遇到拆迁的情况，您可以按照以下步骤处理：
一、确认判决效力
首先，需要确认法院判决的效力。通常，民事案件在判决后会有一定的上诉期。如果在这个上诉期内，没有当事人提起上诉，那么判决就会生效。请确保判决已经生效，这是后续处理拆迁事宜的前提。
二、办理产权变更
在确认判决生效后，您需要凭借生效的判决书前往当地的不动产登记部门，申请办理房屋产权变更登记手续。在办理过程中，您需要准备并提交以下材料：
不动产登记部门在审核通过后，会依法完成产权变更登记，将房屋的产权正式变更到您名下。
三、了解拆迁政策
在产权变更完成后，您需要主动了解当地的拆迁政策和程序。这包括拆迁的补偿标准、安置方式、拆迁时间等具体细节。您可以通过咨询当地拆迁部门或查阅相关政策文件来获取这些信息。
四、与拆迁部门沟通协商
了解了拆迁政策后，您需要主动与拆迁部门进行积极的沟通与协商。在此过程中，您需要表明自己的身份和产权情况，并明确表达自己对拆迁补偿和安置的期望。拆迁部门会根据政策规定和您的实际情况，与您进行协商，并签订拆迁补偿安置协议。
五、签订拆迁补偿安置协议
在与拆迁部门协商达成一致后，您需要签订拆迁补偿安置协议。这份协议会明确规定补偿的具体方式（如货币补偿、产权调换等）、补偿金额、安置房屋的位置和面积等关键条款。请务必仔细阅读协议内容，并确保自己的权益得到充分保障。
六、领取补偿款项或接收安置房屋
最后，根据双方签订的拆迁补偿安置协议的具体约定，您需要按照规定的时间，准时领取相应的拆迁补偿款项，或者接收安排好的安置房屋。请确保按照协议约定履行自己的义务，并妥善保管好相关凭证和文件。
总之，在处理法院判决遗产继承份额后遇到拆迁的情况时，您需要保持冷静、理性应对。通过确认判决效力、办理产权变更、了解拆迁政策、与拆迁部门沟通协商、签订拆迁补偿安置协议以及领取补偿款项或接收安置房屋等步骤，您可以有效地维护自己的合法权益。