关于“第三人将资金误打入借款人还款账户，银行自动扣款后银行是否有退还责任”的问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

结论前置

银行在自动扣款后，是否负有退还责任，需根据具体情况判断。若银行按照与借款人的合同约定进行扣款，且扣款过程无误，则银行通常不承担退还责任。但若银行存在过错，如错误扣款或未尽到合理的审查义务，则可能需承担相应的退还责任。

详细分析

1. 合同关系与扣款行为：

   • 银行与借款人之间通常存在借款合同，其中会明确约定还款账户、还款方式及扣款时间等。
   • 当第三人误将资金打入该还款账户时，若银行按照合同约定的扣款时间和方式进行了扣款，且扣款金额与借款人应还金额相符，则银行的行为是基于合同约定的正当行为。

2. 银行的责任判断：

   • 无过错情况：若银行在扣款过程中严格遵循了合同约定，且没有证据表明银行存在过错（如错误识别款项来源、错误扣款等），则银行不承担退还责任。
   • 有过错情况：若银行在扣款过程中存在过错，如未对款项来源进行合理审查，导致错误扣款，或者扣款金额超出了借款人应还金额，则银行可能需承担退还责任。

3. 第三人的权利救济：

   • 第三人若因误打款而遭受损失，可首先尝试与借款人协商解决，要求借款人返还误打款项。
   • 若协商无果，第三人可考虑通过法律途径维护自身权益，如向法院提起诉讼，要求借款人及（在特定情况下）银行承担相应责任。

4. 建议与提示：

   • 第三人在打款前应仔细核对账户信息，确保款项打入正确账户。
   • 银行在扣款前应尽可能对款项来源进行审查，以避免因错误扣款而引发的纠纷。
   • 若发生类似纠纷，建议各方保持冷静，通过协商或法律途径寻求解决方案。

综上所述，银行在自动扣款后是否负有退还责任，需根据具体情况判断。若银行无过错，则通常不承担退还责任；若银行存在过错，则可能需承担相应的退还责任。同时，第三人也应关注自身权利救济途径，并在打款时保持谨慎。