超员罚款的处理方式主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关法规，并根据车辆类型及超员程度的不同而有所区别。以下是对超员罚款处理的详细解答：

一、驾驶营运客车、校车超员

1. 超员100%以上

   • 罚款：处二百元以上五百元以下罚款；若超过额定乘员20%或违反规定载货，罚款提升至五百元以上二千元以下。
   • 记分：驾驶证一次性扣12分。
   • 其他处罚：可由交通运输主管部门责令停止从事相关营运。

2. 超员20%以上但未达100%

   • 罚款：处五百元以上二千元以下罚款。
   • 记分：驾驶证一次性扣12分。
   • 其他处罚：同样可由交通运输主管部门责令停止从事相关营运。

3. 超员未达20%

   • 罚款：处二百元以上五百元以下罚款。
   • 记分：驾驶证一次性扣6分。
   • 其他处罚：交通运输主管部门可责令停止相关营运。

二、驾驶其他载客汽车超员

1. 超员100%以上

   • 罚款：一般处二百元以上二千元以下罚款。
   • 记分：驾驶证一次性扣12分。

2. 超员20%以上但未达100%

   • 罚款：处二百元以上二千元以下罚款。
   • 记分：驾驶证一次性扣6分。

3. 超员未达20%

   • 罚款：可以处警告或者二十元以上二百元以下罚款。
   • 记分：驾驶证一次性扣3分。

三、驾驶货车载物超过核定载质量

1. 超载30%以上或者违反规定载客

   • 罚款：处五百元以上二千元以下罚款。
   • 记分：驾驶证一次性扣6分。

2. 超载未达30%

   • 罚款：处二百元以上五百元以下罚款。
   • 记分：驾驶证一次性扣3分。

四、综合说明与注意事项

• 罚款缴纳：收到罚款通知后，驾驶员需按指定方式及时缴纳罚款，逾期未缴纳可能产生滞纳金或面临其他法律后果。
• 记分管理：驾驶证记分是我国交通管理的重要措施，超员行为将记相应分数。记分达到一定数量（如12分），可能导致驾驶证被暂扣或吊销，需重新参加交通安全法律法规学习并考试合格后才能恢复驾驶资格。
• 其他严厉处罚：在严重超员或造成严重后果的情况下，驾驶员可能面临拘留、车辆被扣留等更严厉的处罚。
• 特别提醒：校车、客运车辆等特定类型的车辆超员，由于承载更多公共安全责任，处罚通常更加严厉。超员不仅违法且极度危险，易导致交通事故，对乘客生命安全构成严重威胁。

因此，驾驶员应严格遵守交通规则，不超员行驶，确保行车安全。同时，乘客也应选择正规、合法的交通工具，不乘坐超员车辆，共同维护道路交通安全。