机动车颜色不符的处罚是：车主将面临警告或二百元以下罚款，并可能被责令在规定时间内将车身颜色恢复到行驶证上登记的颜色。此外，如果车辆因颜色不符而未能通过年检，将无法合法上路行驶。

详细分析：

1. 法规依据：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》及《机动车登记规定》，机动车的颜色是车辆的重要特征之一，已注册登记的机动车在改变车身颜色后，机动车所有人有义务在规定时间内（变更后十日内）向登记地车辆管理所申请变更登记。

2. 处罚原因：

   • 行驶证是机动车的合法身份证明，其中记录了车辆的基本信息，包括车身颜色。如果车身颜色与行驶证不符，就构成了擅自改变机动车已登记的特征，属于违法行为。

3. 处罚措施：

   • 公安机关交通管理部门将依据相关法规，对车主进行警告或处以二百元以下罚款。
   • 同时，车主还可能被责令在规定时间内将车身颜色恢复到行驶证上登记的颜色，以消除违法状态。

4. 年检影响：

   • 车辆年检是确保车辆安全合法上路行驶的重要环节，其中外观检查是关键部分。
   • 如果车身颜色与行驶证照片不符且未进行备案变更，车辆将无法通过年检，进而无法合法上路行驶。

5. 变更登记流程：

   • 车主在改变车辆颜色后，应及时向登记地车辆管理所申请变更登记。
   • 申请时需提交机动车所有人的身份证明、机动车登记证书、机动车行驶证等相关材料。
   • 车辆管理所会在受理后进行审查，并在机动车登记证书上签注变更事项，重新核发新的行驶证。

总结与建议： 为了避免不必要的法律处罚和车辆年检问题，车主在改变车辆颜色后，应及时办理相关变更登记手续。如果对此有任何疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问，我会为你提供专业的解答。