同一法人的两家企业不可以设置一个支部。接下来，我从法律角度为您详细解释这一结论：
法人与公司独立性的原则：
- 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司具有独立的法人资格，依法独立承担民事责任。这意味着，即使两家公司的法人是同一人，它们仍然是两个独立的法律实体，各自拥有独立的组织架构和管理体系。
支部的设立与组织架构：
- 支部通常指的是党组织或某些特定组织在基层的分支机构。在企业中，支部的设立通常遵循企业的组织架构和管理层级。
- 由于两家公司是独立的法律实体，它们各自应有自己的组织架构，包括支部的设立。因此，不能简单地将两家公司的支部合并为一个。
法律后果与合规性：
- 如果试图将两家公司的支部合并为一个，可能会违反公司法的相关规定，影响公司的独立性和合规性。
- 此外，这样的合并也可能导致管理上的混乱和法律责任的不明确，不利于企业的长远发展。
综上所述，同一法人的两家企业由于各自具有独立的法人资格和组织架构，因此不能设置一个支部。如果您有进一步的公司法务问题或需要更详细的法律建议，请随时向我咨询。