面对高速上超速被扣满12分但实际驾驶员不配合处理的情况，首先需要明确的是，处理这类问题必须遵循相关的法律法规，并确保所有行动都在法律框架内进行。以下是我作为专业律师给出的建议：

1. 明确法律责任：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第二十三条，对在一个记分周期内记分达到12分的，公安机关交通管理部门会扣留其机动车驾驶证，并要求参加道路交通安全法律、法规的学习并接受考试。
   • 实际驾驶员有义务配合处理这一违章行为，包括接受处罚、参加学习和考试等。

2. 应对不配合处理的情况：

   • 沟通协商：首先尝试与实际驾驶员进行沟通，了解其不配合处理的原因，并解释配合处理的重要性和必要性。
   • 法律后果说明：向实际驾驶员明确说明不配合处理可能面临的法律后果，如驾驶证被吊销、罚款增加、甚至可能涉及刑事责任等。
   • 寻求警方协助：如果沟通无果，可以联系当地公安机关交通管理部门，寻求他们的协助。警方有权采取多种措施来强制要求驾驶员配合处理，如传唤、罚款等。

3. 替代处理方案：

   • 如果实际驾驶员确实无法配合处理（如因疾病、出国等原因），可以尝试寻找其授权代理人或法定代理人来代为处理。
   • 在某些情况下，也可以考虑通过法律途径来解决问题，如起诉实际驾驶员要求其履行配合处理的义务。

4. 预防措施：

   • 对于车辆所有者或管理者来说，应加强对驾驶员的管理和教育，确保他们遵守交通规则并了解违章处理的流程。
   • 可以考虑在车辆上安装行车记录仪等设备，以便在发生违章行为时能够迅速确定驾驶员身份并采取措施。

综上所述，高速上超速被扣满12分但实际驾驶员不配合处理是一个比较复杂的问题，需要综合考虑多个方面的因素来采取措施。作为专业律师，我建议首先尝试与实际驾驶员进行沟通协商，并明确说明不配合处理可能面临的法律后果。如果沟通无果，可以寻求警方协助或采取其他法律手段来解决问题。同时，也应加强预防措施来避免类似情况的发生。