取保候审法院决定不起诉，一般情况下不会留下案底。具体分析如下：
没有违法犯罪事实的不起诉：
- 如果犯罪嫌疑人是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉的，则不会有案底。这是因为案底通常指的是犯罪记录，而在没有违法犯罪事实的情况下，自然无法产生犯罪记录。
因犯罪情节轻微或法律规定情形的不起诉：
- 如果犯罪嫌疑人不是因没有违法犯罪事实而被决定不起诉，而是因犯罪情节轻微或具有法律规定的情形之一而被不起诉的，虽然案件未经法院有罪判决，但可能会有相应的案底记载。这是因为犯罪嫌疑人的行为虽然未达到需要追究刑事责任的程度，但仍然存在一定的违法性或不当行为，这可能会被记录在案。
法律依据：
- 根据《刑事诉讼法》第十六条的规定，有下列情形之一的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪：情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；其他法律规定免予追究刑事责任的。这些情形下的不起诉，通常不会留下案底。
综上所述，取保候审后法院决定不起诉，是否会留下案底取决于不起诉的具体原因。如果是因为没有违法犯罪事实而被不起诉，则不会留下案底；如果是因为犯罪情节轻微或具有法律规定的情形之一而被不起诉，则可能会有相应的案底记载。如有进一步疑问或需要详细咨询，请直接向我提问。