当公司被债权人申请破产清算，但公司实际上没有资产时，依然可以依法进行破产清算程序。以下是对此情况的详细解答：
一、破产清算的法律依据与程序
法律依据：
- 即使公司资产不足以覆盖债务，只要符合破产的相关法律条件（如长期无法偿还到期债务），债权人就有权向法院提起破产申请。
- 资产的多少并不是决定公司能否破产的唯一因素，而是需要综合考虑公司的整体财务状况和法律规定。
破产程序：
- 公司进入破产程序后，会由法院指定的专业清算团队对公司的资产、负债等进行全面清查和评估。
- 清算团队会依法对公司的财产进行分配，优先支付员工的工资、社保费用等，然后按照法律规定的顺序清偿其他债务。
二、无资产情况下的破产清算
资产状况确认：
- 清算团队会对公司的资产进行全面核查，确认是否真的没有可供分配的财产。
- 如果确实没有资产，清算团队会依法进行破产清算的后续程序。
债务处理：
- 在没有资产可供分配的情况下，债权人的债务可能无法得到全额清偿。
- 但破产清算程序仍然可以帮助债权人按照法律规定的顺序获得部分清偿或确认债权。
三、员工赔偿与债权人权益
员工赔偿：
- 员工的工资、社保费用等基本权益款项在破产清算中会优先得到支付。
- 如果公司确实没有资产，员工的这些权益可能无法得到全额保障，但破产程序会尽量确保员工的合法权益得到最大程度的保护。
债权人权益：
- 其他与公司有经济往来的债权人，如供应商、银行等，也可以根据法律规定的破产程序申请相应的赔偿。
- 在没有资产的情况下，债权人的债权可能无法得到全额清偿，但破产程序会提供一个公平、透明的债务处理方式。
四、后续建议
咨询专业律师：
- 如果公司面临破产清算的情况，建议尽快咨询专业的律师或法律顾问，以获取更具体的法律建议和帮助。
积极配合清算程序：
- 公司应积极配合清算团队的工作，提供必要的财务资料和文件，以便清算程序能够顺利进行。
综上所述，即使公司被债权人申请破产清算且没有资产，依然可以依法进行破产清算程序。虽然债权人的债务可能无法得到全额清偿，但破产程序会提供一个公平、透明的债务处理方式，并尽量保护员工和债权人的合法权益。