针对不合格的饲料原料，相关的处罚措施主要依据《饲料和饲料添加剂管理条例》进行。具体来说，如果饲料或饲料添加剂生产企业、经营者生产或经营了不符合产品质量标准的饲料，将面临一系列的处罚。

首先，县级以上地方人民政府饲料管理部门会责令相关企业或经营者停止生产、经营，并没收违法所得和违法生产、经营的产品。这是为了防止不合格产品继续流通，对养殖业造成危害。

其次，根据违法生产、经营的产品货值金额，处罚力度也会有所不同。如果货值金额不足1万元，将并处2000元以上2万元以下罚款；如果货值金额1万元以上，则将并处货值金额2倍以上5倍以下罚款。这种罚款制度既体现了对违法行为的惩罚，也考虑了违法行为的严重程度。

此外，如果构成犯罪，还将依法追究刑事责任。这意味着，对于严重的违法行为，不仅会受到行政处罚，还可能面临刑事制裁。

在具体的执法案例中，我们可以看到，对于不合格的饲料原料，相关部门会依法进行调查，并根据调查结果作出相应的处罚决定。例如，在某县兽药店经营不符合产品质量标准的饲料案中，由于该兽药店积极配合调查，且违法行为轻微，最终被责令停止经营不合格饲料，并没收违法所得和罚款。

另一个案例也展示了对于使用药物添加剂品种目录以外的物质生产饲料的严重违法行为，相关部门会依法进行严厉处罚，包括没收违法产品和罚款等。

综上所述，对于不合格的饲料原料，相关部门会依法进行严厉打击，以保障养殖业的安全和健康发展。同时，也提醒广大饲料生产和经营者，要严格遵守相关法律法规，确保产品质量安全。