将借款协议转为购房协议，这一行为的合法性主要取决于双方当事人的真实意思表示以及协议内容是否违反法律法规的强制性规定。

1. 合法有效的情形：

   • 当借贷双方协商一致，自愿将原本的借款合同关系转变为房屋买卖合同关系，且该转变不违反法律法规的强制性规定，也不违反公序良俗时，这种转化通常会被认定为合法有效。例如，债务到期后，双方经对账确认债务数额，并签订商品房买卖合同，将借款本息转为已付购房款，这种交易安排并未违反法律禁止性规定，因此是有效的。
   • 在此情况下，双方应确保购房合同中的条款明确、合法，且购房款（即原借款本息）的数额应符合法律规定，避免将违法高息合法化。

2. 可能无效或可撤销的情形：

   • 如果这种转化是为了规避法律、损害第三人利益或者存在显失公平等情况，合同可能会被认定无效或者可撤销。例如，债务人为了逃避债务，将房屋以明显低于市场的价格“卖”给债权人，从而损害了其他债权人的利益，此时其他债权人可以请求法院撤销该合同。
   • 另外，如果在转化过程中存在欺诈、胁迫等行为，受损害的一方也有权请求法院或者仲裁机构撤销合同。

3. 法律建议：

   • 在进行借款协议转为购房协议的操作前，建议双方咨询专业律师，确保协议内容的合法性和有效性。
   • 双方应保留好原始借款合同、转账记录等相关证据，以备不时之需。
   • 如遇纠纷，应及时通过法律途径解决，维护自身合法权益。

综上所述，借款协议转为购房协议是否合法，需根据具体情况而定。在符合法律法规的前提下，双方协商一致并签订合法的购房合同，是可以实现这一转变的。但如有任何违法或不当行为，都可能影响合同的效力。