村集体补偿分配方案由村民会议或村民代表会议决定。

具体来说，村民会议是由本村十八周岁以上的村民组成，是村集体的最高决策机构，有权讨论决定涉及村民利益的重大事项，包括村集体补偿的分配方案。而村民代表会议则由村民推选的代表组成，在村民会议授权范围内，对一些日常性或专业性较强的事项进行讨论决定。

在决定村集体补偿分配方案时，必须遵循民主、公平、公正的原则，广泛听取村民意见，确保方案的合理性和合法性。同时，整个决策过程应依法进行，并接受村民的监督，以防止出现贪污、挪用等违法违规行为，确保村集体资金的使用和分配公正合理。

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