当公司法人不愿意变更时，我们可以按照以下步骤来处理：

1. 明确原因与协商：

   • 首先，需要明确法人不同意变更的具体原因，可能涉及经济纠纷、责任担忧等。
   • 尝试与原法人进行沟通协商，阐明变更法人的原因与必要性，争取其理解和配合，并告知其拒绝变更可能对公司及自身带来的不利影响。

2. 依据公司章程与法律规定：

   • 查看公司章程，依据公司章程规定，召开股东会或董事会，对法定代表人变更事项进行表决，形成有效的股东会或董事会决议。
   • 若法人存在滥用职权等阻碍变更的行为，其他股东有权向法院提起诉讼，请求法院判决变更法人。

3. 书面通知与保留证据：

   • 若沟通无果，向原法人发出书面通知，明确告知其公司已作出变更法人的决议，要求其配合办理相关变更手续。
   • 在整个过程中，务必注意保留好相关的决议、通知、沟通记录等证据，以维护公司合法权益。

4. 向登记机关反映与办理变更：

   • 可向公司登记机关反映情况，提供相关决议等文件，请求登记机关协助处理。
   • 若法院判决支持变更，或登记机关同意协助处理，可凭借相关文件前往登记机关办理法人变更登记。

5. 法律后果与责任：

   • 根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，如果公司在登记事项发生变更时，没有依法办理有关变更登记的，由公司登记机关责令限期登记；逾期不登记的，处以一万元以上十万元以下的罚款。
   • 因此，若原法人拒绝配合变更，不仅可能影响公司的正常运营，还可能面临法律处罚。

综上所述，当公司法人不愿意变更时，我们应首先尝试通过沟通协商解决问题；若协商无果，则可依据公司章程与法律规定采取相应措施，确保公司的合法权益得到维护。同时，务必注意保留好相关证据，以备不时之需。