村医定向生六年后离职是否有补偿，需根据具体情况分析，特别是合同中的相关条款。
一. 合同约定情况
有明确约定：如果村医定向生在入职时与用人单位签订了书面劳动合同，并且合同中明确规定了离职时的补偿条款，那么六年后离职时，村医定向生有权根据合同条款要求补偿。例如，合同中可能规定了服务年限、离职补偿金等具体内容，这些都是双方应当遵守的约定。
无明确约定或约定不明：如果劳动合同中没有明确约定离职补偿，或者约定不明确，那么村医定向生在离职时可能无法直接依据合同条款要求补偿。此时，需要参考相关的法律法规以及政策文件来确定是否有补偿。
二. 法律法规与政策文件
劳动法规定：根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者与用人单位之间的劳动关系受法律保护。然而，劳动法并未直接规定村医定向生离职时是否有补偿，这需要根据具体的劳动合同以及相关政策文件来判断。
政策文件：对于村医定向生这一特殊群体，政府可能会出台相关政策文件来规范其服务年限、离职补偿等事项。因此，在判断村医定向生离职是否有补偿时，应当查阅相关的政策文件，了解政府对于这一问题的具体规定。
综上所述，村医定向生六年后离职是否有补偿，关键在于劳动合同中的相关条款以及法律法规与政策文件的具体规定。我建议村医定向生在离职前，仔细查阅自己的劳动合同以及相关政策文件，了解自己的权益和义务。如有进一步需要，您可以继续咨询我。