填写劳动仲裁书时，公司名称应写变更后的单位名称。以下是详细分析：

一. 公司名称变更的法律效力

1. 公司名称变更的法律规定：根据《公司法》的相关规定，公司变更名称的，应当自变更决议或者决定作出之日起30日内申请变更登记。公司变更名称后，其法律主体资格并未改变，只是名称发生了变更。
2. 法律效力的延续：公司名称变更后，其原有的权利义务关系由变更后的公司承继。因此，在劳动仲裁书中，应当填写变更后的公司名称，以准确反映当前的法律关系主体。

二. 发工资单位名称与劳动仲裁的关系

1. 发工资的单位名称：发工资的单位名称可能因公司内部的财务管理或劳务派遣等关系而有所不同，但并不一定代表实际的用人单位主体。
2. 劳动仲裁的被申请人：在劳动仲裁中，被申请人应当是与你存在劳动关系的用人单位。因此，无论发工资的单位名称是什么，都应当以与你签订劳动合同或存在实际劳动关系的单位名称为准。

三. 实际填写建议

• 确认劳动关系：在填写劳动仲裁书前，务必确认与你存在劳动关系的单位名称，即你的实际用人单位。
• 填写变更后的名称：如果实际用人单位已经变更了名称，那么应当在劳动仲裁书中填写变更后的单位名称。

综上所述，填写劳动仲裁书时，应当填写变更后的单位名称，以准确反映当前的法律关系主体。同时，也要确保填写的单位名称与与你存在劳动关系的单位一致。如有进一步需要，您可以继续咨询我。