交通运输查处非法营运、超载超限等行为的处罚依据主要包括《中华人民共和国行政处罚法》《公路安全保护条例》《超限运输车辆行驶公路管理规定》以及《河北省公路条例》等相关法律法规。以下是具体的分析：

一. 非法营运、超载超限等行为的法律性质

1. 非法营运：通常指未取得相应许可，擅自从事道路运输经营活动的行为。这违反了道路运输管理法规，扰乱了市场秩序。
2. 超载超限：指货运车辆超过核定的载重或尺寸限制进行运输。这不仅对公路设施造成损害，还危及道路交通安全。

二. 处罚依据

1. 《中华人民共和国行政处罚法》：该法为行政处罚的基本法律，规定了行政处罚的种类、程序等。在交通运输领域，对于非法营运、超载超限等行为，交通运输管理部门可依据该法实施行政处罚。
2. 《公路安全保护条例》：该条例专门针对公路安全保护作出规定，包括禁止超载超限车辆上路行驶等。对于违反条例的行为，交通运输管理部门有权进行处罚。
3. 《超限运输车辆行驶公路管理规定》：该规定详细规定了超限运输车辆的管理要求，包括超限标准、审批程序等。对于违反规定的超限运输行为，交通运输管理部门将依据此规定进行处罚。
4. 《河北省公路条例》：作为地方性法规，该条例对河北省内的公路管理作出具体规定，包括超载超限等违法行为的处罚措施。在河北省内发生的非法营运、超载超限等行为，将依据此条例进行处罚。

三. 处罚措施

根据相关法律法规，对于非法营运、超载超限等行为，交通运输管理部门可以采取多种处罚措施，如罚款、扣押车辆、吊销许可证等。具体处罚措施将根据实际情况和法律法规的规定来确定。

综上所述，交通运输查处非法营运、超载超限等行为的处罚依据主要包括上述法律法规。这些法律法规为交通运输管理部门提供了明确的执法依据和处罚措施，有助于维护道路运输市场秩序和公路安全。