亲子鉴定中，男方孩子不能代替男方进行鉴定。

亲子鉴定是运用生物学、遗传学以及有关学科的理论和技术，根据遗传性状在子代和亲代之间的遗传规律，判断被控的父母和子女之间是否存在亲生关系的鉴定。在亲子鉴定中，通常需要比对被鉴定人的遗传物质，以确定他们之间的亲缘关系。

如果男方因故不能参与亲子鉴定，那么应该寻找其他合法、有效的方式来解决相关问题，比如通过法律程序来确认亲子关系。在任何情况下，都应该尊重科学、尊重法律，确保亲子鉴定的准确性和合法性。

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