摩托车驾驶证在违规时确实会扣分。扣分制度是维护道路交通秩序、保障行车安全的重要手段，对于摩托车驾驶人来说也不例外。

分析说明：

1. 扣分依据：

   • 摩托车驾驶证的扣分依据主要来自于《中华人民共和国道路交通安全法》、《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》以及《道路交通安全违法行为记分管理办法》等法律法规。
   • 这些法律法规明确规定了各类交通违法行为的处罚措施，包括扣分。

2. 扣分情况：

   • 摩托车驾驶人若违反交通规则，如驾驶与准驾车型不符的摩托车、不戴安全头盔等，都将面临扣分的处罚。
   • 具体的扣分分值会根据违法行为的严重程度来确定，例如，驾驶与准驾车型不符的摩托车一次记9分，驾驶摩托车不戴安全头盔一次记1分。

3. 记分管理制度：

   • 记分管理工作由公安机关交通管理部门负责，实行累积记分制度。
   • 记分周期为12个月，满分为12分。若驾驶人在一个记分周期内记分达到12分，将面临相应的法律后果，如暂扣驾驶证等。

法律建议：

• 摩托车驾驶人应严格遵守交通规则，确保自身行为符合交通规范，以避免扣分和处罚。
• 建议驾驶人定期查询自己的记分情况，及时了解自己的交通违法记录，以便及时纠正和改正。
• 加强交通安全意识的学习和培训，提高驾驶技能和安全意识，共同维护良好的道路交通秩序。

综上所述，摩托车驾驶证在违规时会扣分，这是法律规定的必然结果。驾驶人应时刻注意交通安全，遵守交通规则，确保行车安全。