银行大厅经理对纸质存单进行拍照的行为，从法律层面来讲并不合法。具体分析如下：

一. 拍照行为的合法性分析

1. 违反银行规则：金融场所内，出于商业秘密保护和安保考虑，一般不允许随意摄像、摄影。银行有严格规定，未经许可不得拍照，这包括了对存单等银行文件拍照的行为。
2. 侵犯隐私权风险：虽然存单本身可能不包含直接的私密信息，但拍照行为若不慎泄露了储户的其他相关信息，银行需承担法律责任。根据《中华人民共和国民法典》第一千零三十三条，除法律另有规定或权利人明确同意外，任何组织或个人不得拍摄、窥视、窃听、公开他人的私密信息。

二. 应对建议

1. 警告并要求删除：发现大厅经理拍照后，应立即警告并要求其删除照片，同时确保其承诺保密。
2. 加强账户监控：随后应加强对自己账户的监控，一旦发现异常交易或行为，及时报警。
3. 收集证据并报警：如果因拍照行为导致存单信息被滥用，如遭盗刷或诈骗，应立即收集证据并报警。

综上所述，银行大厅经理对纸质存单进行拍照的行为并不合法，主要违反了银行规则和可能侵犯储户的隐私权。我建议您采取上述应对措施，以保护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。