全国公民婚姻状况查询系统本身并不必然违法，但其合法性取决于使用目的、方式及是否获得相关授权。以下是对此问题的详细分析：
一. 合法使用与非法使用的界限
合法使用：根据相关法律法规，如为了政府管理、司法调查、公共服务等正当目的，且依法获得授权，查询公民婚姻状况是合法的。例如，公安机关、法院、检察院等机关在办理案件时，根据需要可以依法查询相关人员的婚姻状况。
非法使用：未经授权或出于非法目的（如窥探他人隐私、进行非法交易等）查询公民婚姻状况，则属于违法行为。这种行为侵犯了公民的隐私权，违反了相关法律法规。
二. 相关法律依据
《中华人民共和国民法典》第一千零三十三条：除法律另有规定或者权利人明确同意外，任何组织或者个人不得实施下列行为：（一）以电话、短信、即时通讯工具、电子邮件、传单等方式侵扰他人的私人生活安宁；（二）进入、拍摄、窥视他人的住宅、宾馆房间等私密空间；（三）拍摄、窥视、窃听、公开他人的私密活动；（四）拍摄、窥视他人身体的私密部位；（五）处理他人的私密信息；（六）以其他方式侵害他人的隐私权。
《中华人民共和国个人信息保护法》：该法明确了个人信息的处理原则、处理规则以及个人信息权益等，对于非法获取、出售或者提供公民个人信息的行为，将依法追究法律责任。
三. 结论与建议
结论：全国公民婚姻状况查询系统本身并非必然违法，其合法性取决于使用目的、方式及是否获得相关授权。未经授权或出于非法目的查询公民婚姻状况，则属于违法行为。
建议：在使用全国公民婚姻状况查询系统时，应确保自己的行为符合法律法规的规定，尊重并保护公民的隐私权。如有查询需求，应依法获得授权，并严格按照授权范围进行查询。
综上所述，全国公民婚姻状况查询系统的合法性取决于具体的使用情境和方式。在使用时，请务必遵守相关法律法规，尊重并保护公民的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。