非法经营罪情节特别严重的立案标准，主要依据《中华人民共和国刑法》第二百二十五条的规定，以及相关的司法解释和修正案。具体来说，非法经营罪涉及多种行为，包括未经许可经营专营、专卖物品，买卖进出口许可证等经营许可证，非法经营证券、期货、保险业务，以及非法从事资金支付结算业务等其他严重扰乱市场秩序的行为。

对于情节特别严重的非法经营行为，立案标准通常涉及较高的数额或者造成严重的后果。以非法经营证券、期货、保险业务或者非法从事资金支付结算业务为例，如果数额在150万元以上，或者非法从事资金支付结算业务数额在1000万元以上，又或者违反国家规定使用销售点终端机具（POS机）等方法以虚构交易等方式向信用卡持卡人直接支付现金数额在500万元以上，这些都将被视为情节特别严重。

此外，如果个人非法经营数额在50万元以上，或者违法所得数额在10万元以上；单位非法经营数额在250万元以上，或者违法所得数额在50万元以上，这些也属于情节特别严重的情形。还有一种情况是，虽然非法经营数额或者违法所得数额未达到上述标准，但如果两年内因同种非法经营行为受过两次以上行政处罚，又进行同种非法经营行为，同样会被视为情节特别严重。

总的来说，非法经营罪情节特别严重的立案标准是一个综合性的考量，包括非法经营的数额、造成的后果、行为的性质以及是否有重复违法等因素。在具体案件中，司法机关会根据这些因素进行综合考虑，以确定是否构成情节特别严重，并据此作出相应的量刑决定。