单位申请的工伤认定两年半后通常难以推翻。下面我将从相关法律规定、推翻工伤认定的条件以及实际操作难度等方面进行详细解释。

1. 相关法律规定：

   • 根据《工伤保险条例》及相关法律法规，工伤认定是社会保险行政部门根据相关法规作出的行政决定。一般情况下，工伤认定结论作出后，即具有法律效力。
   • 申请行政复议的期限通常是自知道具体行政行为之日起六十日内，而提起行政诉讼的期限则是自知道或应当知道行政行为之日起六个月内。超出这些期限，通常将无法通过正常法律途径再次审查工伤认定结论。

2. 推翻工伤认定的条件：

   • 要推翻工伤认定结论，必须有新的、足够有力的证据。这些证据可能包括关键证人证言、新发现的物证，或者能够证明原认定依据的事实是虚假的证据。
   • 另一种情况是原认定程序存在严重违法，如负责认定的工作人员与案件有利害关系却未回避，或者认定过程中严重违反了法定程序。

3. 实际操作难度：

   • 在实践中，要获取新的、足以推翻原工伤认定结论的证据往往非常困难。随着时间推移，证人可能难以寻找，关键物证也可能丢失或损坏。
   • 同时，由于已经错过了申请行政复议和提起行政诉讼的法定时间，单位很难再通过法律途径来推翻工伤认定。

综上所述，单位申请的工伤认定两年半后通常难以推翻。如果单位对工伤认定有异议，应在法定期限内及时通过合法途径提出，并充分准备相关证据材料。若已错过法定期限且无法获取新证据，则推翻工伤认定的可能性极低。因此，建议单位在处理工伤问题时务必谨慎，确保工伤认定的准确性和合法性。