孩子三个月大时，离婚一般会判给母亲。根据《民法典》第一千零八十四条的规定，离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。这是因为婴幼儿在哺乳期更依赖母亲的照料，由母亲抚养更有利于其健康成长。以下是对此结论的详细解释和可能存在的特殊情况：

1. 法律规定：

   • 《民法典》第一千零八十四条明确规定，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。这是基于婴幼儿成长的需要和母亲在哺乳期对子女的特殊照顾能力而制定的。

2. 特殊情况：

   • 尽管原则上会判给母亲，但也存在一些特殊情况。例如，如果母亲患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活；或者母亲有抚养条件却不尽抚养义务，而父亲要求子女随其生活，并且能够提供更好的抚养环境，那么在这种情况下，法院也可能会将抚养权判给父亲。

3. 法院判定原则：

   • 法院在判定抚养权归属时，会从最有利于未成年子女成长的角度出发，综合考量父母双方的抚养能力、抚养条件以及子女的实际需要等因素。因此，即使母亲在某些方面存在不足，但如果父亲也无法提供更好的抚养环境，那么法院仍然可能会将抚养权判给母亲。

4. 建议：

   • 对于离婚双方来说，无论抚养权最终判给谁，都应该以子女的利益为重，确保子女能够得到良好的成长环境和足够的关爱。同时，不直接抚养子女的一方也应该履行抚养义务，按照协议或法院判决支付抚养费。

综上所述，孩子三个月大时离婚，一般会判给母亲抚养。但也存在特殊情况，需要法院根据具体情况进行综合判定。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的解答，请直接向我咨询。