当有牌照的摩托车和无牌无证的电动三轮车发生交通事故时，处理流程主要涉及以下几个方面：

一、立即停车并保护现场

根据《道路交通安全法》第七十条，道路上发生交通事故时，车辆驾驶人应立即停车，保护现场。若造成人身伤亡，驾驶人应迅速抢救受伤人员，并立即报告执勤的交通警察或公安机关交通管理部门。同时，若因抢救受伤人员而变动现场，应标明位置，以便后续调查。

二、责任判定

1. 责任判定的原则：

   • 公安机关交通管理部门会依据各当事人的行为对引发道路交通事故的影响及其过失程度，来确定各自的责任。
   • 若因一方当事人的过失导致事故发生，则需承担事故的全部责任。
   • 若事故由双方或多方当事人的过失引发，则需根据其行为对事故发生的影响及过失程度，分别承担主要责任、同等责任和次要责任。
   • 若各方当事人均无过失，且事故是由交通意外事件引起，则各方均无需承担责任。

2. 无证驾驶与责任判定的关系：

   • 无牌无证驾驶电动三轮车虽然违反了相关法律规定，但这并不直接影响责任判定。责任判定主要依据的是当事人的行为对事故发生的影响及过失程度。
   • 无证驾驶者可能会面临公安机关交通管理部门依法给予的罚款处罚（二百元至二千元之间）。

三、抢救费用与赔偿

1. 抢救费用：

   • 医疗机构对交通事故中的受伤人员应及时抢救，不得因抢救费用未及时支付而拖延救治。
   • 若肇事车辆参加了机动车第三者责任强制保险，由保险公司在责任限额范围内支付抢救费用。
   • 若抢救费用超过责任限额，或肇事车辆未参加机动车第三者责任强制保险、肇事后逃逸，由道路交通事故社会救助基金先行垫付部分或全部抢救费用。道路交通事故社会救助基金管理机构有权向交通事故责任人追偿。

2. 损害赔偿：

   • 当事人可以根据事故责任认定书，协商处理损害赔偿事宜。
   • 若协商不成，可以通过法律途径解决，如向法院提起诉讼。

四、特殊情况的处理

• 若涉及未成年人骑电动车发生事故，应依照法律程序，由交警大队出具事故责任认定书，明确各方的责任分担比例，并根据相关法律法规进行后续处理。

综上所述，处理有牌照的摩托车和无牌无证的电动三轮车发生的交通事故时，应首先保护现场、抢救伤员，并立即报警。随后，公安机关交通管理部门会进行责任判定，并根据判定结果处理抢救费用和损害赔偿事宜。同时，对于无证驾驶等违法行为，公安机关交通管理部门会依法进行处罚。