起诉时提交聊天记录电子版是可以作为证据使用的，但需要注意以下几点以确保其有效性：

首先，根据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》，微信聊天记录、微博、电子邮件、电子交易记录等均属于电子证据。当事人以电子数据作为证据的，应当提供原件，即原始载体，包括储存有电子数据的手机、计算机或者其他电子设备等。这意味着你需要确保提交的聊天记录是未经篡改、删除或修改的原始记录。

其次，为了证明聊天记录中的对方就是案件当事人，你需要提供能够证明对方真实身份的信息。这可以通过某一笔转账记录去申请微信转账电子凭证，核实对方提供的真实姓名来实现。此凭证是由深圳腾讯公司旗下的财付通支付科技有限公司出具的，具有法律效力。

在提交聊天记录时，你还需要注意以下几点：

1. 提交完整的聊天记录，不能仅截取对自己有利的部分。聊天记录应该完整不间断，以反映对话的全过程。
2. 对聊天记录进行整理、标注，包括具体的日期、昵称代表的人物等信息。图片及文档要另行打印具体内容，语音要转化成文字，视频要用光盘等存储设备保存。
3. 如果涉及微信转账交易记录，你可以直接从微信中调取账单并下载作为证据。

最后，尽管微信聊天记录可以作为证据使用，但在司法实践中，法院对其真实性和证明力会进行审慎审查。因此，为了确保你的权益得到充分保障，建议在起诉前尽可能收集更多相关证据，形成完整的证据链，以增加胜诉的可能性。

总之，聊天记录电子版在起诉时是可以作为证据使用的，但需要遵循一定的规定和注意事项来确保其有效性和证明力。