刑事案件中，被告人最担心的三个原因通常与证据、法律适用和程序公正有关。具体分析如下：

一. 证据问题

1. 证据不足或不利：在刑事案件中，证据是定罪量刑的关键。如果被告人担心证据不足或证据对自己不利，这将是他们最害怕的原因之一。因为证据不足可能导致无法证明自己的清白，而不利的证据则可能直接导致定罪。

• 例如，如果案发现场没有监控录像，且没有其他直接证据，被告人可能会担心无法证明自己不在案发现场，从而被误判。

二. 法律适用问题

1. 法律条款的解读和适用：刑事案件涉及复杂的法律条款和规定，被告人可能担心法律条款的解读和适用对自己不利。特别是当法律条款存在模糊或争议时，法官的解读和判决可能对被告人产生重大影响。

• 例如，对于某项罪名的构成要件，如果法律条款表述不够明确，法官在解读时可能存在一定的主观性，这可能导致被告人被错误地定罪。

三. 程序公正问题

1. 程序违法或不当：刑事案件的审理需要遵循严格的法定程序。如果被告人担心程序存在违法或不当之处，如证据收集不合法、审判过程不公正等，这将严重影响他们对案件结果的信心。

• 例如，如果侦查人员在收集证据时存在逼供、诱供等违法行为，这可能导致证据的有效性受到质疑，进而影响案件的判决结果。同时，如果审判过程中存在偏袒一方、忽视证据等不当行为，也会让被告人对案件的公正性产生怀疑。

综上所述，刑事案件中，被告人最担心的三个原因分别是证据问题、法律适用问题和程序公正问题。这些问题直接关系到被告人的切身利益和案件的最终结果，因此他们需要特别关注并寻求专业的法律帮助来维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。