针对您提出的“有驾驶证驾驶不能上牌的机动车怎么处罚”的问题，以下是根据相关法律法规和常规处理流程给出的详细解答：
首先，我们要明确的是，驾驶不能上牌的机动车，即未悬挂机动车号牌的车辆上路，是违反《中华人民共和国道路交通安全法》的行为。对于这种情况，公安机关交通管理部门将依据相关法规进行处罚。
一、处罚措施
罚款：
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的，可处警告或者二十元以上二百元以下罚款。在有证驾驶无牌机动车的情形下，通常会处以20元以上200元以下的罚款，但具体数额由公安机关交通管理部门根据实际情况决定。若车辆有临时牌照但未按要求悬挂，也可能面临类似的罚款。
扣分：
- 根据最新的《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶未悬挂机动车号牌的机动车上路行驶，一次记9分（注：此前可能记12分，但根据新规定已调整为9分）。这一措施旨在加强对驾驶人的管理，并提醒其对道路交通安全给予足够重视。
扣留机动车：
- 公安机关交通管理部门会依法扣留未悬挂号牌的机动车，直至当事人提供相应的牌证、标志或者补办相应手续。这是为了确保车辆合法上路，维护道路交通秩序和安全。在当事人提供相应牌证或补办手续后，机动车会及时被退还。
二、特殊情况说明
- 如果驾驶的无牌机动车还存在其他违法行为，如车辆达到报废标准、套牌、酒驾或醉驾等，处罚会更加严重。可能面临更高额的罚款、更严重的扣分、吊销驾驶证、拘留甚至刑事责任等后果。
- 若因驾驶无牌机动车而引发交通事故或造成其他严重后果，驾驶人还需承担相应的法律责任和赔偿责任，包括但不限于民事赔偿、刑事责任等。
三、建议与提醒
为了避免不必要的法律风险和处罚，我强烈建议所有驾驶人：
- 遵守道路交通安全法规，确保车辆合法上路行驶。
- 如果车辆尚未悬挂号牌，请尽快到相关部门办理相关手续。
- 提高交通安全意识，共同维护良好的道路交通环境。
综上所述，有驾驶证驾驶不能上牌的机动车将面临罚款、扣分以及扣留机动车等处罚措施。请务必遵守相关法律法规，确保车辆合法上路，共同维护道路交通安全。