扣工资超过20%申请劳动仲裁是有用的。下面我为您详细解释：

首先，如果公司扣除了您超过20%的工资，且没有合法合理的依据，这属于无故克扣工资的行为。根据法律规定，您完全有权申请劳动仲裁，要求公司补发被克扣的工资，并可能要求公司承担相应的赔偿责任。

其次，在申请劳动仲裁时，您需要准备充分的证据来证明公司存在无故克扣工资的行为。这包括但不限于工资条、银行流水、公司规章制度、劳动合同等。只有提供了充分的证据，才能增加您仲裁成功的可能性。

另外，也需要注意一些特殊情况。如果公司有明确合法的规章制度，并且该规章制度规定了绩效工资的扣除情形和比例，且在实际执行中也是按照规定操作的，那么这种情况下扣除超过20%可能是合理合法的，仲裁可能不会得到支持。但是，如果公司虽然有制度规定，但在实际执行中存在不合理或者与制度不符的情况，例如随意解释制度、故意针对个别员工等，您仍然可以申请仲裁维护自己的权益。

最后，我想提醒您的是，申请劳动仲裁需要遵循一定的程序和时间限制。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。因此，如果您决定申请劳动仲裁，请务必在时效期间内提出，并遵循相关的程序规定。

总之，扣工资超过20%申请劳动仲裁是有用的，但您需要准备充分的证据，并遵循相关的程序和时间限制。如果您在申请劳动仲裁过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。